1999年（31歳）
埼玉の太田真一を目標に指名し、盤石の体制で挑んだ1999年だったが、最終ホームで競り込んだ小倉竜二を落車させてしまい、初の失格に終わった。
2000年（32歳）
昨年とは違い、太田とは別線勝負を選択した2000年だったが、終始後方に置かれて見せ場なし。5着に終わった。
2001年（33歳）
2001年も後方に置かれ、見せ場なく終わる。直線では内の選手の煽りを食って落車となり、再入の9着に終わった。なお、この年限りで1991年からのグランプリ連続出場が途絶えた。
2004年（36歳）
3年ぶりのグランプリ出場となった2004年は、最終ホーム8番手から巻き返しを取ったが、逃げる東北勢を捲れず9着。自力戦での限界が見て取れる結果となった。
2005年（37歳）
オールスターを連覇して挑んだ2005年は、武田豊樹が前を回り、3番手を後閑信一が固める関東ラインの番手。武田が先手を奪い、盤石の態勢に思われたが、最終3コーナーで優勝した加藤慎平に内を掬われ6着に終わった。
2009年（41歳）
4年ぶりの出場となった2009年は、平原康多―武田豊樹の後ろ、関東ライン3番手。しかし最終2コーナーで前に踏み遅れ、4着に敗れた。
2014年（46歳）
G1戦線で安定した結果を残し、5年越しの出場となった2014年も、平原―武田の3番手に。首尾よく平原が主導権を奪ったが、勝負所で村上義弘に内を掬われ、6着に敗れた。
2015年（47歳）
直近で最後のグランプリ出場となった2015年も、やはり武田―平原の3番手。しかし最終バックで捲りを放った平原に離れ、7着に敗れた。
まとめ
神山雄一郎と、KEIRINグランプリの出場結果は以下の通り。
| 開催年 | 年齢 | 着順 |
| 1991年 | 23歳 | 8着 |
| 1992年 | 24歳 | 3着 |
| 1993年 | 25歳 | 5着 |
| 1994年 | 26歳 | 6着 |
| 1995年 | 27歳 | 2着 |
| 1996年 | 28歳 | 2着 |
| 1997年 | 29歳 | 2着 |
| 1998年 | 30歳 | 2着 |
| 1999年 | 31歳 | 失格 |
| 2000年 | 32歳 | 5着 |
| 2001年 | 33歳 | 9着 |
| 2004年 | 36歳 | 9着 |
| 2005年 | 37歳 | 6着 |
| 2009年 | 41歳 | 4着 |
| 2014年 | 46歳 | 6着 |
| 2015年 | 47歳 | 7着 |
23歳～47歳まで、合計16回に渡り出場してきた実力はもちろん、2014年には46歳でS級S班復帰・グランプリ出場を果たすなど、常識外れの活躍を示してきた神山雄一郎。しかし、そんな神山でも手に入れることが出来なかったのが、グランプリのタイトルである。一発勝負の難しさ、重圧を、奇しくも裏付ける結果となっている、と言えるだろう。
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